國家植物園由國家林業局、中科院、陜西省政府、西安市政府聯合共建。規劃投資15.5億元人民幣，總面積639平方公里，落差2000多米。自2000年開始建園以來，秦嶺國家植物園目前已完成投資約9億元。

秦嶺國家植物園

秦嶺國家植物園，位于陜西省西安市周至縣境內，由陜西省人民政府、國家林業局、中國科學院、西安市人民政府聯合共建的國家級特大型綜合植物園。距十三朝古都西安70千米。

秦嶺國家植物園距市中心60千米， 總面積639平方千米。地理區位為東經108°13′—108°29′、北緯33°43′—34°04′之間，屬暖溫帶大陸性山地氣候。年平均降水800—900毫米，年平均溫度8℃—10℃。兼具物種保育、科學研究、公眾教育、生態旅游四項功能。

秦嶺國家植物園落差2000多米，是世界上面積最大、植被分帶最清晰、最具自然風貌的植物園，也是中國第一個國家級植物園。

1998年6月，植物園開始籌建，在中科院西安分院副院長沈茂才研究員承擔的“秦巴山區優勢生物資源綜合開發利用與保護”課題的基礎上，2000年06月，陜西省長辦公會議決定建設秦嶺植物園。

秦嶺國家植物園總投資達15.5億人民幣，分別由陜西省人民政府、國家林業局、中國科學院和西安市人民政府按照1：1：1：0.5的比例籌措建設資金，重點完成基礎設施建設任務，為秦嶺國家植物園建設奠定基礎。為了使資金盡快得到周轉，植物園項目籌備組還向亞洲銀行申請了3500萬美元貸款，向GEF申請1000萬美元贈款。最終，秦嶺國家植物園成為亞洲銀行在中國扶持的第一個生物多樣性保護項目，獲得了4000萬美元貸款，并獲得500萬美元全球環境基金贈款。

2001年02月，陜西省人民政府批準建設秦嶺植物園，規劃面積458平方千米，建設植物遷地保護區、動物遷地保護區、生物多樣性就地保護區以及農業觀光和生態度假區等四個區，是集生物多樣性保護、科學研究、科普教育和生態旅游為一體的世界上最大的植物園。

2001年11月，陜西省政府常務會議決定成立陜西省秦嶺植物園，同年12月，陜西省編委批復成立陜西省秦嶺植物園，加掛陜西省秦嶺植物研究院牌子，為陜西省政府直屬正廳級事業單位。

2005年08月，秦嶺植物園劃入陜西省林業廳代管。

2006年10月10日，在北京召開了陜西省政府、國家林業局、中國科學院、西安市政府聯合共建第一次會議，將名稱正式確定為秦嶺國家植物園。

2007年05月30日，陜西省政府、國家林業局、中國科學院、西安市政府聯合在周至縣集賢鎮舉行秦嶺國家植物園奠基儀式，拉開了秦嶺國家植物園建設的大幕。

2012年，重點建設項目共10個，總投資13.5億。

2014年10月21日上午，秦嶺國家植物園與中國銀行陜西分行，在西安舉行全面業務合作協議簽字儀式。中國銀行十億授信秦嶺國家植物園配套設施建設及其相關產業發展。

截至2017年初，秦嶺國家植物園已完成投資約9億元，建成以“濕地奇草、花海異木、山居峽谷、小徑民宿”為主要內容的智慧植物園，完成了海棠園、竹亞科園、薔薇園等8個專科專類園和花園溝花卉引種區等18個項目。3000平方米標本館、6000平方米溫室館、1400平方米VR智能科普館、大門廣場等11個項目開工建設，完成了十余個民宿改造設計項目以及金牛坪、栗子坪、九斤坪、殿鎮新街4個風情小鎮的建設規劃。

2018年04月13日，陜西師范大學與秦嶺國家植物園、陜西省社會科學界聯合會等6家單位聯合共建的教學實踐基地和青少年科普教育基地揭牌儀式在秦嶺國家植物園舉行。

2019月01月09日，秦嶺國家植物園園藝中心在園藝中心辦公樓舉行了揭牌儀式。  

2019年03月09日，由秦嶺國家植物園主辦、多家單位協辦的秦嶺國家植物園暨第二屆秦嶺植樹季開幕，來自全國各地近3000名游客見證開幕儀式并參加活動。